Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms