Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms