Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF4Q8WV16 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms