Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC93Q567U6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms