Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms