Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms