Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN9AQ15858 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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