Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms