Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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