Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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