Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms