Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms