Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PGDP52209 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms