Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLK1P49759 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLK1P49759 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLK1P49759 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLK1P49759 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLK1P49759 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLK1P49759 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLK1P49759 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLK1P49759 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLK1P49759 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLK1P49759 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLK1P49759 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLK1P49759 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLK1P49759 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLK1P49759 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLK1P49759 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLK1P49759 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLK1P49759 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLK1P49759 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLK1P49759 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLK1P49759 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLK1P49759 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLK1P49759 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLK1P49759 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLK1P49759 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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