Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms