Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms