Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms