Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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