Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PTPRAP18433 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PTPRAP18433 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PTPRAP18433 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PTPRAP18433 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PTPRAP18433 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PTPRAP18433 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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PTPRAP18433 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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PTPRAP18433 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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PTPRAP18433 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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