Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms