Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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USP18Q9UMW8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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USP18Q9UMW8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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USP18Q9UMW8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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USP18Q9UMW8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
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