Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms