Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms