Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVK-5Q9HDB9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVK-5Q9HDB9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms