Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms