Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms