Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRIP1Q9BX63 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms