Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms