Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms