Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF1Q8N6C5 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms