Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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