Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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