Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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