Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms