Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms