Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSNAXIP1Q2TAA8 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms