Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HADHQ16836 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HADHQ16836 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HADHQ16836 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HADHQ16836 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HADHQ16836 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HADHQ16836 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHQ16836 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms