Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FSCN1Q16658 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms