Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC1Q15915 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC1Q15915 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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ZIC1Q15915 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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ZIC1Q15915 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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