Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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