Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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