Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTBQ06643 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTBQ06643 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTBQ06643 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTBQ06643 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTBQ06643 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms