Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms