Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUCB1Q02818 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms