Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RBMS3-207ENST00000445033 1120 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CKMT2-AS1-206ENST00000511495 585 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC079866.1-201ENST00000534985 1220 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC010615.2-205ENST00000599993 929 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 FLJ22447-202ENST00000556569 1312 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TMED6-201ENST00000288025 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TMEM59-203ENST00000371341 1116 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TMPRSS11GP-201ENST00000431070 1204 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC022294.1-201ENST00000460993 865 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 BLOC1S6-208ENST00000565323 688 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 FYTTD1-203ENST00000415708 1342 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms