Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COG7P83436 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COG7P83436 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COG7P83436 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COG7P83436 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COG7P83436 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COG7P83436 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COG7P83436 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COG7P83436 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COG7P83436 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COG7P83436 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COG7P83436 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COG7P83436 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms