Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPAP53621 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms