Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms