Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PI4KAP42356 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PI4KAP42356 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PI4KAP42356 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms