Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT1P26358 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms